تخضع مستشفى المنصورة للتأمين الصحي لرقابة الجهاز المركزى للمحاسبات بكافة شعبه وتتم هذه الرقابة بشكل مستمر, هذا بالإضافة إلى الرقابة الداخلية المستمرة على جميع جوانب العمل بالمستشفى.

بالنسبة لرسم المرافق الذى يتم تحصيله فقيمته 30 جنيها للمرافق بالدرجة التأمينية و40 جنيها للمرافق بالقسم الإقتصادى طبقا لقرار رئيس مجلس إدارة الهيئة رقم 749 لسنة 2008.

أما بالنسبة لعدم توفير سرير للمرافق فإنه طبقا للقرارات المنظمة فإنه غير مسموح بتخصيص سرير للمرافق بالدرجة التأمينية لضمان عدم إشغال أسرة المرضى بهذه الدرجة ويسمح بكرسى للمرافق فى هذه الدرجة. أما لمرافق القسم الإقتصادى فإنه مسموح بسرير للمرافق.

تقدم مستشفى المنصورة للتأمين الصحي خدمات طبية متميزة يومياً لجميع المرضى ولا مجال لأى فوضى أو تسيب بالمستشفى, وتطبيق القرارات المنظمة بشأن تحصيل رسوم المرافق لا تعنى أنه يوجد فوضى وإنما العكس هو الصحيح.