انطلاقا من مبدأ فصل التمويل عن الخدمة الذى أقره وأكد أهميته الحزب الوطني الديموقراطي ومجلس الشورى ودراسات المجالس القومية الطبية المتخصصة لضمان رفع جودة الخدمات الصحية، وإضافة إلى أن مبدأ فصل التمويل عن الخدمة هو أحد المبادئ الجوهرية التي أقرتها منظمة الصحة العالمية كأساس لأي نظام تأمين صحي اجتماعي يسعى إلى تحقيق العدالة الكاملة بين المواطنين,فأنه من الضرورى التأكيد على أن هذا الفصل لا يستهدف إطلاقاً الخصخصة من أى نوع ولكن يستهدف بالأساس رفع كفاءة الإدارة في المستشفيات والمراكز التابعة للتأمين الصحي، إضافة إلى رفع مستويات الجودة الطبية لضمان تقديم الرعاية الطبية بجودة عالية.
تهدف الهيئة العامة للتأمين الصحى إلى الوصول إلى التميز فى تقديم الخدمة من خلال إنشاء وحدة مستقلة تكون مسئولة عن اعتماد استيفاء وحدات تقديم الخدمة لمعايير الجودة القياسية وذلك فى المجالات التالية :-
تهدف الهيئة العامة للتأمين الصحى إلى رفع كفاءة وحدات تقديم الخدمة التابعة لها عن طريق إعطاء فرص متكافئة لجميع هذه الوحدات لكى تشارك فى تحقيق هدف التامين الصحى على أساس الجودة والسعر المناسب.